Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H8

TMEM53, Transmembrane protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM53Q6P2H8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM53Q6P2H8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM53Q6P2H8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
TMEM53Q6P2H8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TMEM53Q6P2H8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM53Q6P2H8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms