Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms