Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF6Q6KF10 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms