Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL2Q6F5E8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms