Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF123Q5XPI4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF123Q5XPI4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms