Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRIP1Q5VSL9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms