Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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