Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDK2Q58EX2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms