Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms