Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDRF1Q3B7T1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms