Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM16LQ309B1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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