Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms