Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms