Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KNOP1Q1ED39 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KNOP1Q1ED39 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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