Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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