Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
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