Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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PTPROQ16827 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPROQ16827 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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