Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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