Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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