Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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GABRA6Q16445 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GABRA6Q16445 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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