Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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VAMP3Q15836 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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VAMP3Q15836 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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VAMP3Q15836 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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VAMP3Q15836 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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VAMP3Q15836 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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VAMP3Q15836 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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VAMP3Q15836 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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VAMP3Q15836 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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