Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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