Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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