Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.683e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 PUF60-217ENST00000531951 973 ntTSL 318.26■□□□□ 0.513e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 PUF60-205ENST00000524570 1934 ntTSL 216.25■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 PUF60-212ENST00000528320 922 ntTSL 214.52□□□□□ -0.093e-6■■■■□ 21.5
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PCBP2Q15366 PUF60-221ENST00000533162 761 ntTSL 314.09□□□□□ -0.153e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 PUF60-215ENST00000529999 867 ntTSL 313.94□□□□□ -0.183e-6■■■■□ 21.5
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PCBP2Q15366 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 PUF60-211ENST00000527744 1007 ntTSL 211.96□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 PUF60-210ENST00000527584 547 ntTSL 28.1□□□□□ -1.113e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.39■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.51■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.88□□□□□ -0.192e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 LRRC8D-204ENST00000441269 905 ntTSL 36.86□□□□□ -1.314e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.24e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 NOTUM-202ENST00000425009 996 ntTSL 322.7■■□□□ 1.224e-11■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 SEMA4G-211ENST00000521006 4656 ntTSL 1 (best)12.97□□□□□ -0.334e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.019e-14■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 RNGTT-204ENST00000627296 2017 ntTSL 214.99□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.511e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 RNGTT-201ENST00000369475 1725 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.721e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 HNRNPH1-238ENST00000521116 806 ntTSL 420.52■□□□□ 0.882e-16■■■■□ 21.5
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PCBP2Q15366 HNRNPH1-207ENST00000503105 559 ntTSL 316.18■□□□□ 0.182e-16■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 HNRNPH1-208ENST00000503664 569 ntTSL 415.62■□□□□ 0.092e-16■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-16■■■■□ 21.5
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PCBP2Q15366 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.132e-16■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-16■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.222e-16■■■■□ 21.5
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PCBP2Q15366 HNRNPH1-224ENST00000514731 1371 ntTSL 213.63□□□□□ -0.232e-16■■■■□ 21.5
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PCBP2Q15366 HNRNPH1-217ENST00000510431 620 ntTSL 212.67□□□□□ -0.382e-16■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 HNRNPH1-234ENST00000519707 582 ntTSL 212.67□□□□□ -0.382e-16■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 HNRNPH1-211ENST00000504779 792 ntTSL 512.67□□□□□ -0.382e-16■■■■□ 21.5
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PCBP2Q15366 HNRNPH1-232ENST00000519056 530 ntTSL 411.03□□□□□ -0.642e-16■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 HNRNPH1-219ENST00000512273 501 ntTSL 48.01□□□□□ -1.132e-16■■■■□ 21.5
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PCBP2Q15366 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.142e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.192e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.422e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.522e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.127e-12■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.321e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.713e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.433e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 WDR25-205ENST00000554492 510 ntTSL 416.78■□□□□ 0.283e-6■■■■□ 21.5
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PCBP2Q15366 WDR25-206ENST00000554998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.433e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 SPATA18-210ENST00000514670 551 ntTSL 422.01■■□□□ 1.118e-8■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 SPATA18-207ENST00000508915 569 ntTSL 422.01■■□□□ 1.118e-8■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 SPATA18-206ENST00000506829 620 ntTSL 320.46■□□□□ 0.878e-8■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.614e-8■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.254e-8■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 SPATA18-204ENST00000505038 588 ntTSL 513.2□□□□□ -0.38e-8■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 MOB4-202ENST00000323303 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.573e-21■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 RAB11FIP5-204ENST00000482554 2810 ntTSL 49.93□□□□□ -0.824e-8■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 RAB11FIP5-206ENST00000493523 4008 ntTSL 29.09□□□□□ -0.954e-8■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.323e-21■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 AFF1-207ENST00000511442 463 ntTSL 32.94□□□□□ -1.942e-7■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.185e-7■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.045e-7■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.235e-7■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.235e-7■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.245e-7■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 COPS7B-210ENST00000413197 2442 ntTSL 213.5□□□□□ -0.255e-7■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.315e-7■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 COPS7B-209ENST00000412922 1935 ntTSL 511.11□□□□□ -0.635e-7■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.368e-7■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.691e-7■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.395e-7■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 GLYR1-207ENST00000587936 897 ntTSL 512.64□□□□□ -0.391e-9■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.51e-9■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 GLYR1-202ENST00000436648 3466 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.561e-9■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 GLYR1-210ENST00000589389 3606 ntTSL 1 (best)11.24□□□□□ -0.611e-9■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 GLYR1-209ENST00000588732 3527 ntTSL 1 (best)9.7□□□□□ -0.861e-9■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.12e-9■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.62e-9■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 VPS16-201ENST00000380443 1825 ntTSL 1 (best)22.86■■□□□ 1.252e-9■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.982e-9■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 RHBDF2-216ENST00000592123 935 ntTSL 520.76■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 21.4
PCBP2Q15366 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.99e-8■■■■□ 21.4
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