Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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RABEP1Q15276 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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RABEP1Q15276 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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RABEP1Q15276 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABEP1Q15276 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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