Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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