Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NR1D2Q14995 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NR1D2Q14995 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms