Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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