Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA3CQ13748 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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