Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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