Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms