Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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