Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LSAMPQ13449 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LSAMPQ13449 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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