Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PMS2P3Q13401 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms