Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SP140Q13342 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SP140Q13342 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SP140Q13342 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP140Q13342 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP140Q13342 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP140Q13342 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP140Q13342 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP140Q13342 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP140Q13342 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP140Q13342 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP140Q13342 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SP140Q13342 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SP140Q13342 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP140Q13342 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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