Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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