Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK3Q13003 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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