Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP1Q12981 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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