Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC10A2Q12908 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms