Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFRD2Q12894 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFRD2Q12894 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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