Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms