Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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EFEMP1Q12805 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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EFEMP1Q12805 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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EFEMP1Q12805 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFEMP1Q12805 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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