Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCAPQ12770 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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