Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms