Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms