Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TLE4Q04727 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TLE4Q04727 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TLE4Q04727 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms