Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PLOD1Q02809 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms