Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms