Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms