Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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